cds区:将基因的外显子拼接到一起就是cds区么

1.将基因的外显子拼接到一起就是cds区么

外显子还包括5‘和3’UTR，CDS是外显子拼接以后从起始密码子到终止密码子之间的序列。

2.老师，你好，我想问克隆基因CDS区的时候，要设引物，设引物的时候，怎

你就可以直接上genebank其序列,你需要扩增的CDS区,可以全外显子扩增,也可以做cDNA克隆,前者的话就可以直接根据其基因序列NG号设计引物,如果是做CDNA的话就根据其mRNA的序列NM号设计引物. 你是根据其cDNA设计的引物,

3.对一个基因进行生物信息学分析是不是利用CDS区就可以了

基因发挥功能具有时空特异性。CDS提供的是基因的编码区信息，可推根据同源性测其功能和是否分泌到胞外等。

4.解释CDS、cDNA、EST、mRNA、ORF间的区别？

外显子还包括5‘和3’UTR，CDS是外显子拼接以后从起始密码子到终止密码子之间的序列。

5.cds区测序结果与ncbi有几个碱基的突变

最简单的就是拿去测序 CDS区完全正确就可以了验证功能的话就做western 以及检测该基因下游targets的表达量 比如它可以促进A的表达 就转染细胞后检测A的表达量是否上升

6.基因有多个cds区，怎么清楚的分析蛋白以确定基因的功能

blast工具。序列相似，往往功能也相似“

7.转录组测序得到的完整cds区可信吗

转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合，转录组测序(RNA-seq) 是最近发展起来的利用深度测序技术进行转录分析的方法,可以对全转录组进行系统的研究。Roche GS FLX Titanium 、Illumina Solexa GA IIx和AB SOLID 4均可以对转录组进行测序，适用于表达量较高基因的RNA全长测序。但是对低表达丰度的基因，可能需要多次测序才能得到足够的数据，若是位置基因组序列的物种，则Roche GS FLX Titanium测序更有优势，转录组测序可以供研究者在转录本结构研究（基因边界鉴定、可变剪切研究等），转录本变异研究（如基因融合、编码区 SNP研究），非编码区域功能研究（Non-coding RNA研究、miRNA前体研究等），基因表达水平研究以及全新转录本发现等方面进行深入研究。研究转录组的方法有哪些？目前研究转录组的方法主要三种，基于杂交技术的cDNA芯片和寡聚核苷酸芯片，基于第二代测序技术的转录组测序，转录组测序比其他研究方法有哪些优势?转录组测序具有以下优势：（1）可以直接测定每个转录本片段序列、单核苷酸分辨率的准确度，同时不存在传统微阵列杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题；可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录本；（3）可以对任意物种进行全基因组分析，无需预先设计特异性探针，因此无需了解物种基因信息，能够直接对任何物种进行转录组分析，同时能够检测未知基因，并准确地识别可变剪切位点及cSNP，高于6个数量级的动态检测范围，能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。转录组测序有什么样的样品要求？OD值应在1.8至2.2之间；电泳检测28S:（2）样品浓度：（3）total RNA样品请置于-20℃保存；请提供total RNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。管上注明样品名称、浓度以及制备时间，建议使用干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。mRNA的纯化分离方法？进行mRNA研究中，首先需要对样本进行总RNA抽提，抽提得到的RNA除含有mRNA外，还含有rRNA和tRNA，为防止这两类RNA对转录组研究的影响，因此我们需要对mRNA进行分离纯化。真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构（m7G）和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly（A）尾，提供了极为方便的选择性标志，寡聚（dT）纤维素或寡聚（U）琼脂糖亲合层析分离纯化mRNA的理论基础就在于此。mRNA的分离方法较多，其中以寡聚（dT）-纤维素柱层析法最为有效，此法利用mRNA 3’末端含有Poly（A+）的特点，在RNA流经寡聚（dT）纤维素柱时，在高盐缓冲液的作用下，mRNA被特异地结合在柱上，当逐渐降低盐的浓度时或在低盐溶液和蒸馏水的情况下，mRNA被洗脱，经过两次寡聚（dT）纤维柱后，即可得到较高纯度的mRNA。使用Solexa进行转录组测序时，样本RNA如何进行片段化处理？