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1.Xilinx和Pico Computing联手推出业界首款15Gb/s HMC接口

北京2014年6月24日电 /美通社/ -- All Programmable 技术和器件的全球领先企业赛灵思公司(Xilinx,XLNX))和同为混合内存立方体联盟(HMCC)成员的 Pico Computing 公司,器件的 15Gb/s 混合内存立方体(HMC)接口。器件可支持由64个收发器组成的四信道 HMC 带宽,且运行速率高达15Gb/s。而且又具备模块化和高度可扩展性能,可提供极高的内存带宽以及卓越的单位功耗性能。这两种技术的完美组合使工程师能够利用这套解决方案立即开展15Gb/s HMC 设计,满足高性能计算、包处理、波形处理以及图像与视频处理等领域的应用需求。混合内存立方体(HMC)是一款高性能内存解决方案,能提供前所未有的高带宽、高能效和高可靠性。支持该标准的广泛推广。赛灵思公司电源和存储器技术市场总监 Tamara Schmitz 表示:客户现在即能采用业界唯一出货的20nm FPGA 以及经验证的 IP 核向市场推出15Gb/s HMC 设计“UltraScale FPGA 是目前唯一能支持 HMC 所有四条信道的可用器件。可实现全内存带宽,同时其更多收发器可用于数据路径和控制信号,Pico Computing 的 HMC 控制器高度参数化。具备真正优化的系统配置”可满足客户特定的设计目标要求。

2.Chem & Coding | Linux系统下GAMESS与wxMacMolPlt的编译和测试

提供了一个分享一点儿经验的平台。这篇文章其实两年前就想写了,本文主要针对刚刚接触计算化学和Linux的初高中生本科生研究生等小伙伴们,本文信息主要来源于网络资料整理,最后会附上链接,【简介】The General Atomic and Molecular Electronic Structure System (GAMESS)is a general ab initio quantum chemistry package.GAMESS是一个通用量子化学从头计算软件包,可以完成大量的基本计算,功能不亚于Gaussian,Windows和几种Linux发行版下的源代码包预构建成二进制文件。如果预构建的二进制文件可用于您的平台,请优先尝试使用wxMacMolPlt,以避免构建过程中出现任何问题。【使用本文方法需要】:1.一台有键盘的电脑(废话),可以没有鼠标(反正Linux又不需要)推荐还是要有至少双核2.7 GHz,硬盘大约留出1G空间2.电脑上装了Linux的操作系统,发行版个人最推荐的是基于Ubuntu的Mint,对新手界面很友好而且很漂亮。其他发行版命令稍有不同。本文基于Linux Mint 17.33.知道基本的什么是终端,什么是Bash,什么是编译(不用很明确,看下百度有个大概印象就行),启动终端可按Win键然后输入Terminal,关于终端的界面如有疑问请留言,下次更新会详细介绍4.Vim文本编辑器基本操作,可以用gedit等图形化界面编辑文本文件。(下面的命令vim blabla统统改成gedit blabla)但是如果是用SSH协议等登录的Linux账号就比较麻烦。还是建议尽早掌握相关Vim使用。在Windows下可以平时就用GNU编译的Gvim或者Cygwin包下的Vim等进行练习,养成多看相关教程经验,很快进步会很大的5.必要的编译器和解释器等的基础安装gcc,等等几乎成这类量子计算化学的软件标配了。对于其他一些程序,python也是很重要的。gcc之类的可以这样一个一个安装:(以下所有命令在终端中输入后回车,可以在别的地方拷贝后按鼠标中键粘贴或者用键盘,终端中复制快捷键是Ctrl+Shift+C,粘贴是Ctrl+Shift+V,下载源有默认的,改完了记得执行sudo apt-get update更新源)sudo apt-get install -y gccsudo是指临时借用管理员的权限来执行一条命令,安装时候不可避免要往系统文件里添一些东西,所以要加sudo,这时候只要下一条命令打sudo!apt-get是从ppa源里面找到相应程序后进行操作的命令!install和-y以及gcc是它的参数,代表安装gcc。-y是安装的时候,问是否确认时默认确认,这些都可以在帮助菜单中查到,关于如何使用linux下的帮助,可以参考我的 VIM如何永久性显示行号。一次性安装常见的build需要的各种组件:这就提示我们还要额外装csh:sudo apt-get install csh6 下载相关软件包GAMESS和其推荐配套使用的图形化软件wxmacmolplt都是免费的软件,Linux版下载后都是未编译状态,需要自己根据自己的计算机环境进行编译。GAMESS Installation Instructions for Linux大概是要你填一份个人信息和同意版权声明的确认单,然后收邮件得到一个提取码,自行下载需要的版本,网站英语应该不难。注意提取码是一周一换的,如果都过期了就要重新申请。//brettbode.github.io/wxmacmolplt/downloads.html这个下载可能是要翻墙的,我网盘里有一份:https:71qb接下来还需要一些库:这个库是免费的,即英特尔数学核心函数库,提供了经过高度优化和大量线程化处理的数学例程,面向性能要求极高的科学、工程及金融等领域的应用。后面的GAMESS和wxMacMolPlt都要依赖于这个库,下载地址:GTK+(GIMP Toolkit)是一套源码以LGPL许可协议分发、跨平台的图形工具包。最初是为GIMP写的,已成为一个功能强大、设计灵活的一个通用图形库,是GNU/Linux下开发图形界面的应用程序的主流开发工具之一。G应该是GNU的G,wxMacMolPlt里面的图形化界面需要这个,查看是否安装了GTK:pkg-config --list-all | grep gtk如果没有安装,什么都不会输出。OpenGL(全写Open Graphics Library)是指定义了一个跨编程语言、跨平台的编程接口规格的专业的图形程序接口。它用于三维图像(二维的亦可),是一个功能强大,调用方便的底层图形库。在wxMacMolPlt处理三维图像时推荐使用的一个包,还是有别的编译方式的,但是这个最方便最常用。安装OpenGL Library:sudo apt-get install libgl1-mesa-dev安装OpenGL Utilities:sudo apt-get install libglu1-mesa-dev安装OpenGL Utility Toolkitsudo apt-get install libglut-dev上面一步如果报错,是版本问题,sudo apt-get install freeglut3-dev即可。wxWidgets是一个C++库,它允许开发人员使用该代码库为Windows,Linux和其他平台编写应用程序。它与Python,Perl,Ruby和许多其他的流行语言都可以建立连接。与其他跨平台工具包不同,wxWidgets为应用程序提供真正的本地感,因为它使用所处平台的本地API而不是模拟GUI。开源的和成熟的。下载地址:Downloads - wxWidgets安装与编译:先解压下载的包(建议先把下载的包的放在$HOME里,或者叫/home/你的用户名/:后找config或者configure文件,这个文件通常是一个脚本文件,会提示你输入电脑的各种环境啊配置啊,然后生成一个配置文件,用来指导接下来具体的编译方式。执行这个文件,所以加上参数--with-opengl:./configure --with-opengl这些内容在注释里都有提示。执行脚本文件过程中,按照提示一步一步回答问题即可然后编译:make这一步通常用时较长,注意观察屏幕输出信息看有没有报错,或者输出信息从定向,把上句改成make 2>&1 1>./make.log最后在系统里添加相关软件位置信息等等sudo make install通常步骤到此就结束了。如果中途报错,可能要先在环境变量path里加两个库的位置:SEARCH_LIB="| sed s@include@$wx_cv_std_libpath@g` /usr/$nwx_cv_std_libpath /usr/lib/i386-linux-gnu /usr/lib/x86_64-linux-gnu"或者直接永久添加:user> pkg-config --variable=libdir gln /usr/lib/i386-linux-gnu【正文:安装步骤】好了,到了GAMESS和wxMacMolPlt本身的安装了。1.安装wxMacMolPlt比较简单# 版本号可能不一样,请自行改正ntar -zxf wxmacmolplt-7.6.1-linux.tar.gzncd wxmacmolplt-7.6.1-linuxnchmod -R 750 .n# 下一行执行过程中按照提示回答n./configure --with-gtk --with-opengl --enable-unicodenmakensudo make install2.安装GAMESS稍微麻烦一些# 版本号可能不一样,请自行改正tar -zxf gamess-current.tar.gzncd gamess-currentnchmod -R 750 .n./confign# 此处回答问题时注意一下几点:n# 此问在另一个终端下输入gfortran --version查询n# Enter your choice of 'mkl' or 'atlas' or 'acml' or 'none':n# 回答mkl库安装位置,可以用which去查找然后自己定位一下n# 通常可能是/opt/intel/mkl或/opt/intel/composerxe/mkln# communication library ('sockets' or 'mpi')?这样就执行完了confign# 编译DDI并行计算ncd ddin./compddin# 生成libddi.a和ddikick.x两个文件,libddi.a放在/gamess/ddi/,编辑一下文件:这一部分一会儿再写 先测试非并行计算:./runall 0000是刚才设置的gamess版本号用./tests/standard/checktst可以检查是否47个测试文件全都正常通过,都正常通过说明安装顺利。删掉输出文件,再测试并行计算:./runall 00 22代表同时使用2个CPU。然后再检查一次:./tests/standard/checktst这次有几个是不能并行运算的,包括测试文件5,如果除了这几个都没有问题,就说明并行计算也是好的了。参考资料:GAMESS version May 1 linux64 Gfortran+MKL编译详细过程ubuntu 下 Intel MKL库的安装配置Error with MKL and GAMESShttp:

3.【预告】【上海】12.21-22 COMICUP25 魔都同人祭

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